Si certains instruments ont disparu il en reste un certain nombre. Un inventaire réalisé en 199x par le ministère de la culture donne :
- le télescope de Foucault, la lunette et le sidérostat sont toujours sur le site historique de l’Observatoire de Marseille sur le plateau Longchamp,
- les instruments inscrits aux Monuments Historiques sont stockés, avec les ouvrages anciens, dans une réserve de la Ville de Marseille :
- certains instruments sont en dépôt au Musée d’Histoire de Marseille :